La gestion du projet est assurée par une structure formée par le coordinateur, les chefs de file de chacune des actions et les participants aux actions. Tous les participants au projet font partie de l'Assemblée Générale. Le coordinateur est responsable de la gestion et de l'administration du projet ; il facilite ainsi son développement, surveille les ressources, contrôle la qualité des résultats et permet un flux sécurisé d'informations entre les partenaires.
Le coordinateur doit s'assurer que le projet atteint ses objectifs et que ses résultats sont conformes à la feuille de route en termes d’échéances, de livrables et de ressources. Les activités de gestion consistent à : (a) rédiger et signer un accord de consortium avec tous les partenaires, (b) assurer une collaboration efficace au sein de l'équipe et le respect des obligations contractuelles par tous les participants, (c) servir de point de contact entre le consortium DOMINO et le secrétaire Core-Organic, (d) faciliter la communication au sein du projet (site web du projet, réunion de lancement, comités de pilotage, visites d'échanges entre partenaires), e) organiser la rédaction des rapports de réalisation du projet, f) garantir la justesse des reversements et gérer la production des rapports financiers pour la Commission Européenne, g) coordonner la logistique des réunions et la communication interne, au sein et entre WP ; h) appliquer des procédures pour garantir la qualité du déroulement du projet et sa conformité aux exigences de la Commission Européenne et aux accords de consortium.
Les chefs de file des actions relèvent du coordinateur et sont responsables de toutes les tâches de leur action respective. Ils garantissent le respect des échéances et de la remise des livrables, préparent les rapports scientifiques de l’action dont ils sont responsables et les remettent au coordinateur. Le coordinateur surveille la mise en œuvre efficace et efficiente du projet et fait un rapport à l'AG. Les chefs de file des actions, sous la supervision du coordinateur, contribuent (a) aux tâches spécifiques de chaque action, (b) à la remise au coordinateur de rapports scientifiques sur leurs activités, (c) aux publications et (d) aux comités de pilotage du projet.
La gestion administrative et financière du projet est assurée au quotidien par un service spécifique de l’UPM. Celui-ci établit des liens avec les services homologues des partenaires du projet, afin de faciliter la communication, notamment en ce qui concerne les rapports financiers et les questions logistiques. Le suivi des activités administratives et financières du projet, et notamment le suivi des dépenses, sont effectués à l'occasion des réunions annuelles. Leurs conclusions sont utilisées pour la gestion des risques, et prises en compte au besoin pour réorienter les activités du projet ou leur déroulé.
Le WP1 coordonne également l'approche scientifique concernant les méthodes utilisées, en normalisant les différents dispositifs expérimentaux et l’analyse des données.